गुरुद्वारा श्री बावली साहिब भोपाल में ईदगाह हिल्स के नियामतपुरा में स्थित है। स्थानीय परंपरा के अनुसार, गणपत लाल नामक एक व्यक्ति, जो एक स्त्री के प्रति अपने दुराचरण के कारण कभी शापित हुआ था, गंभीर रूप से बीमार पड़ा और किसी वैद्य या उपचारक से उसे राहत नहीं मिली। अपने ही परिवार द्वारा ठुकराए जाने पर, वह उस स्थान के निकट, जो अब गुरुद्वारा श्री टेकरी साहिब है, एक छोटी झोंपड़ी में रहने लगा। एक दिन जब सूफ़ी संत पीर जलालुद्दीन वहाँ से गुज़रे, तो गणपत लाल उनके चरणों में सहायता माँगते हुए गिर पड़ा, और पीर ने उससे कहा कि केवल बाबा नानक ही उसकी सच्ची सहायता कर सकते हैं — और तब से गणपत लाल निरंतर गुरु नानक का नाम पुकारने लगा।
उसकी पुकार सुनकर गुरु नानक देव जी स्वयं इस स्थान पर आए। जब गणपत लाल ने दया की भीख माँगी, तो गुरु साहिब ने भाई बाला जी से पानी लाने को कहा; यद्यपि भाई बाला जी ने खोजा और कुछ न पाया, गुरु साहिब ने उनसे कहा कि पानी उनके सामने ही है, और तुरंत पानी मिल गया। गुरु साहिब ने भाई बाला जी से रबाब बजवाया और स्वयं गणपत लाल पर जल छिड़का, जो आनंद से गुरु नानक का नाम पुकारने लगा और रोगमुक्ति का आशीर्वाद पाया। जब गणपत लाल को होश आया, तब तक गुरु साहिब प्रस्थान कर चुके थे, किंतु जिस पत्थर पर वे खड़े थे उस पर उनके चरणों की छाप रह गई — और जहाँ पानी प्रकट हुआ वह स्थान गुरुद्वारा श्री बावली साहिब बना।